O primeiro padre a trabalhar aqui, em Alphaville – Santana de Parnaíba, foi o Pe. Guilherme Krupp, que celebrava inicialmente nas residências dos moradores, por não ter ainda uma igreja no bairro.

Em 1983, a Construtora Albuquerque Takaoka doou um terreno de mil e quinhentos metros, em frente ao Residencial 9, para a construção de uma Capela, como se dizia na época.

Foi sucedido pelo Pe. Achilles Marenghi, do Clero Diocesano de Jundiaí, e após pouco tempo, pelo Pe. Chistovão Arnault, da Congregação dos Padres do Espírito Santo, que construiu a Casa Paroquial.

Diante da fragilidade do padre e das necessidades pastorais, foi criada a Paróquia Bom Pastor de Alphaville, desmembrada da Paróquia de Santa Ana. Aos 27 de novembro de 1993, D. Roberto Pinarello de Almeida, Bispo Diocesano de Jundiaí, deu posse ao Pe. Paulo Toni Jr. na missão de pároco. Foram criadas várias pastorais e incentivadas as que já existiam; e o grande projeto era a construção do templo para acolher os fiéis.

Com o crescimento dos frequentadores, percebia-se que era pequeno o terreno à disposição. O Pe. Paulo, então, procurou o Dr. Renato Albuquerque, acompanhado do Eng. Othílio Moura, apresentando projeto remodelado e pedindo a doação da área ao lado da antiga Igreja e Casa Paroquial já construídas.

Assim foi doado o atual terreno de aproximadamente vinte e três mil metros. Toda comunidade se empenhou na nova construção, e aos 3 de maio de 1998 foi consagrado o Templo atual por D. Amaury Castanho, Bispo Diocesano. No altar principal, um granito de uma tonelada, estão colocadas – como antigo costume cristão – as relíquias de São Vicente de Paulo, Santa Luiza de Marilac e Santa Catarina Labouré, cujos túmulos se encontram em Paris, na Capela da Medalha Milagrosa.

No Advento de 1999, foram inaugurados três sinos, dedicados a Imaculada Conceição, a São José e ao Papa João Paulo II, respectivamente.

No Ano Santo de 2000, foi inaugurado o Domus Mater Dei (nome dado em homenagem a Mãe de Deus), com salas de reunião e catequese.

Em 2001, o Pe. Paulo, com um grupo de paroquianos(as), funda a Comunidade de Amor Rainha da Paz, para atendimento a crianças pobres com alguma deficiência física ou mental.

Aos 8 de dezembro de 2004, foi colocada a pedra fundamental da atual construção da Rainha da Paz.
Em fevereiro de 2005, assumiu o segundo pároco, o Pe. Félix Xavier, também do Clero Diocesano, que permaneceu até fevereiro de 2011, quando o Pe. Carlos Rafael Casarin é nomeado o terceiro pároco. Em janeiro de 2018, D. Vicente Costa, Bispo de Jundiaí, nomeia o quarto pároco, o Pe. Paulo Toni Jr.

Em Janeiro de 2025, D. Arnaldo Carvalheiro nomeia como quinto pároco Pe. Diego Marques Araujo
Deus seja louvado nesta bela caminhada de tantos irmãos e tantas irmãs, alguns desses já na Casa do Pai, que colaboraram e tornaram possível o anúncio do Evangelho de Jesus Cristo, o Bom Pastor!